MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011988	CAA	2	6	269200	269205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106347
4502	NC_011988	CAG	2	6	269278	269283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106347
4503	NC_011988	GC	3	6	269382	269387	0 %	0 %	50 %	50 %	222106347
4504	NC_011988	CGA	2	6	269493	269498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106347
4505	NC_011988	GCC	2	6	269536	269541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106347
4506	NC_011988	CG	4	8	269577	269584	0 %	0 %	50 %	50 %	222106347
4507	NC_011988	ATT	2	6	269590	269595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106347
4508	NC_011988	CAG	2	6	269611	269616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106347
4509	NC_011988	AGA	2	6	269643	269648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106347
4510	NC_011988	CAG	2	6	269653	269658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106347
4511	NC_011988	AGGA	2	8	269711	269718	50 %	0 %	50 %	0 %	222106347
4512	NC_011988	GAA	2	6	269719	269724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106347
4513	NC_011988	TCT	2	6	269738	269743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106347
4514	NC_011988	ATA	2	6	269752	269757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106347
4515	NC_011988	CCAGG	2	10	269812	269821	20 %	0 %	40 %	40 %	222106347
4516	NC_011988	CCAT	2	8	269822	269829	25 %	25 %	0 %	50 %	222106347
4517	NC_011988	ACG	2	6	269882	269887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106347
4518	NC_011988	CCG	2	6	269901	269906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106347
4519	NC_011988	GGC	2	6	269970	269975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106347
4520	NC_011988	CGA	2	6	270015	270020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106347
4521	NC_011988	AAC	2	6	270037	270042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106347
4522	NC_011988	GCA	2	6	270748	270753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106348
4523	NC_011988	GCC	2	6	270835	270840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106348
4524	NC_011988	AAGG	2	8	270841	270848	50 %	0 %	50 %	0 %	222106348
4525	NC_011988	CG	4	8	270896	270903	0 %	0 %	50 %	50 %	222106348
4526	NC_011988	CGC	2	6	270981	270986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106348
4527	NC_011988	GCTG	2	8	271095	271102	0 %	25 %	50 %	25 %	222106348
4528	NC_011988	TCG	2	6	271124	271129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106348
4529	NC_011988	TTC	2	6	271243	271248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106348
4530	NC_011988	TGC	2	6	271446	271451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106348
4531	NC_011988	GCA	2	6	271465	271470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106348
4532	NC_011988	TGA	2	6	271508	271513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106348
4533	NC_011988	AAG	2	6	271514	271519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106348
4534	NC_011988	GCG	2	6	271570	271575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106348
4535	NC_011988	GC	3	6	271587	271592	0 %	0 %	50 %	50 %	222106348
4536	NC_011988	GGC	2	6	271801	271806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106349
4537	NC_011988	GGGC	2	8	271891	271898	0 %	0 %	75 %	25 %	222106349
4538	NC_011988	GGT	2	6	271915	271920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106349
4539	NC_011988	GC	3	6	271940	271945	0 %	0 %	50 %	50 %	222106349
4540	NC_011988	GCA	2	6	271986	271991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106349
4541	NC_011988	ACC	2	6	272015	272020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106349
4542	NC_011988	TCT	2	6	272111	272116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106349
4543	NC_011988	TGC	2	6	272122	272127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106349
4544	NC_011988	GGC	2	6	272128	272133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106349
4545	NC_011988	TGC	2	6	272137	272142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106349
4546	NC_011988	GCGG	2	8	272174	272181	0 %	0 %	75 %	25 %	222106349
4547	NC_011988	CTGC	2	8	272199	272206	0 %	25 %	25 %	50 %	222106349
4548	NC_011988	TTG	2	6	272214	272219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106349
4549	NC_011988	ATC	2	6	272268	272273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106349
4550	NC_011988	TGG	2	6	272463	272468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106349
4551	NC_011988	TGA	2	6	272473	272478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106349
4552	NC_011988	GGGC	2	8	272483	272490	0 %	0 %	75 %	25 %	222106349
4553	NC_011988	TCA	2	6	272506	272511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106349
4554	NC_011988	CAGC	2	8	272543	272550	25 %	0 %	25 %	50 %	222106349
4555	NC_011988	GGC	2	6	272551	272556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106349
4556	NC_011988	CGC	2	6	272683	272688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106349
4557	NC_011988	CCT	2	6	272689	272694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106349
4558	NC_011988	GTT	2	6	272743	272748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106349
4559	NC_011988	CGA	2	6	272749	272754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106349
4560	NC_011988	TGT	2	6	272766	272771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106349
4561	NC_011988	ATC	2	6	272782	272787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106349
4562	NC_011988	ATC	2	6	272820	272825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106349
4563	NC_011988	CAC	2	6	272865	272870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106349
4564	NC_011988	GCT	2	6	272983	272988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106349
4565	NC_011988	GCC	2	6	272999	273004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106349
4566	NC_011988	ATG	2	6	273061	273066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106349
4567	NC_011988	GCA	2	6	273107	273112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106350
4568	NC_011988	ATG	2	6	273122	273127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106350
4569	NC_011988	ACC	2	6	273193	273198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106350
4570	NC_011988	TGA	2	6	273200	273205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106350
4571	NC_011988	GCC	2	6	273267	273272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106350
4572	NC_011988	GCC	2	6	273286	273291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106350
4573	NC_011988	GGCA	2	8	273297	273304	25 %	0 %	50 %	25 %	222106350
4574	NC_011988	TC	3	6	273483	273488	0 %	50 %	0 %	50 %	222106350
4575	NC_011988	GGTG	2	8	273489	273496	0 %	25 %	75 %	0 %	222106350
4576	NC_011988	AGC	3	9	273497	273505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106350
4577	NC_011988	ATG	2	6	273533	273538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106350
4578	NC_011988	ACCG	2	8	273561	273568	25 %	0 %	25 %	50 %	222106350
4579	NC_011988	GGC	2	6	273621	273626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106350
4580	NC_011988	GCC	2	6	273679	273684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106350
4581	NC_011988	GTG	2	6	273694	273699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106350
4582	NC_011988	CGG	2	6	273712	273717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106350
4583	NC_011988	TGG	2	6	273770	273775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106350
4584	NC_011988	GACCC	2	10	273786	273795	20 %	0 %	20 %	60 %	222106350
4585	NC_011988	TGT	2	6	274001	274006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106350
4586	NC_011988	CGT	2	6	274041	274046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106350
4587	NC_011988	GGCA	2	8	274050	274057	25 %	0 %	50 %	25 %	222106350
4588	NC_011988	CAA	2	6	274080	274085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106350
4589	NC_011988	CACGG	2	10	274151	274160	20 %	0 %	40 %	40 %	222106350
4590	NC_011988	AGGC	2	8	274175	274182	25 %	0 %	50 %	25 %	222106350
4591	NC_011988	CAT	2	6	274200	274205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106350
4592	NC_011988	GCG	2	6	274223	274228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106350
4593	NC_011988	GCT	2	6	274251	274256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106350
4594	NC_011988	CGG	2	6	274260	274265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106350
4595	NC_011988	AATC	2	8	274299	274306	50 %	25 %	0 %	25 %	222106350
4596	NC_011988	TTC	2	6	274316	274321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106350
4597	NC_011988	GCC	2	6	274324	274329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106350
4598	NC_011988	CG	3	6	274335	274340	0 %	0 %	50 %	50 %	222106350
4599	NC_011988	GGC	2	6	274362	274367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106350
4600	NC_011988	GCCGG	2	10	274394	274403	0 %	0 %	60 %	40 %	222106350
4601	NC_011988	TGC	2	6	274412	274417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106350
4602	NC_011988	CGC	2	6	274490	274495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106350
4603	NC_011988	TGA	2	6	274535	274540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106350
4604	NC_011988	CAT	2	6	274624	274629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106351
4605	NC_011988	CGC	2	6	274639	274644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106351
4606	NC_011988	CATTGC	2	12	274666	274677	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222106351
4607	NC_011988	GCG	2	6	274868	274873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106351
4608	NC_011988	CTG	2	6	274925	274930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106351
4609	NC_011988	TGC	2	6	274959	274964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106351
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4614	NC_011988	TGC	2	6	275122	275127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106351
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4617	NC_011988	TTGC	2	8	275313	275320	0 %	50 %	25 %	25 %	222106351
4618	NC_011988	GGT	2	6	275327	275332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106351
4619	NC_011988	GAC	2	6	275383	275388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106351
4620	NC_011988	TC	4	8	275392	275399	0 %	50 %	0 %	50 %	222106351
4621	NC_011988	GGCTAT	2	12	275402	275413	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222106351
4622	NC_011988	GTG	2	6	275423	275428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106351
4623	NC_011988	GGC	2	6	275467	275472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106351
4624	NC_011988	CCA	2	6	275484	275489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106351
4625	NC_011988	TCG	2	6	275493	275498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106351
4626	NC_011988	GCT	2	6	275566	275571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106351
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4629	NC_011988	CGGG	2	8	275722	275729	0 %	0 %	75 %	25 %	222106352
4630	NC_011988	CAT	2	6	275754	275759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106352
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4633	NC_011988	CTG	2	6	276091	276096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106352
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4640	NC_011988	GCT	2	6	276378	276383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106352
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4643	NC_011988	CGGCG	2	10	276544	276553	0 %	0 %	60 %	40 %	222106352
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4730	NC_011988	TCG	2	6	281112	281117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106356
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4733	NC_011988	GC	3	6	281171	281176	0 %	0 %	50 %	50 %	222106356
4734	NC_011988	GAT	2	6	281189	281194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106356
4735	NC_011988	CATCGA	2	12	281212	281223	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222106356
4736	NC_011988	TGC	2	6	281241	281246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106356
4737	NC_011988	GCG	2	6	281253	281258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106356
4738	NC_011988	CAC	3	9	281267	281275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106356
4739	NC_011988	GA	3	6	281283	281288	50 %	0 %	50 %	0 %	222106356
4740	NC_011988	ATG	2	6	281343	281348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106356
4741	NC_011988	CAT	2	6	281356	281361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106357
4742	NC_011988	TGC	2	6	281365	281370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106357
4743	NC_011988	GCA	2	6	281378	281383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106357
4744	NC_011988	ATC	2	6	281398	281403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106357
4745	NC_011988	CAG	3	9	281467	281475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106357
4746	NC_011988	CAC	2	6	281494	281499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106357
4747	NC_011988	GC	3	6	281740	281745	0 %	0 %	50 %	50 %	222106357
4748	NC_011988	GA	3	6	281747	281752	50 %	0 %	50 %	0 %	222106357
4749	NC_011988	GAT	2	6	281781	281786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106357
4750	NC_011988	CA	3	6	281838	281843	50 %	0 %	0 %	50 %	222106357
4751	NC_011988	GC	3	6	281906	281911	0 %	0 %	50 %	50 %	222106357
4752	NC_011988	GGC	2	6	281918	281923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106357
4753	NC_011988	TGC	2	6	281931	281936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106357
4754	NC_011988	GGT	2	6	281999	282004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106357
4755	NC_011988	GTT	2	6	282039	282044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106357
4756	NC_011988	GCA	2	6	282071	282076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106357
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4759	NC_011988	CGTC	2	8	282345	282352	0 %	25 %	25 %	50 %	222106357
4760	NC_011988	GA	3	6	282491	282496	50 %	0 %	50 %	0 %	222106357
4761	NC_011988	CCG	2	6	282522	282527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106357
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4764	NC_011988	GCCG	2	8	282583	282590	0 %	0 %	50 %	50 %	222106357
4765	NC_011988	CTG	2	6	282613	282618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106357
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4769	NC_011988	GGC	2	6	282748	282753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106357
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4773	NC_011988	GCA	2	6	283081	283086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106358
4774	NC_011988	GGC	2	6	283130	283135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106358
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4778	NC_011988	GCT	2	6	283230	283235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106358
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4784	NC_011988	C	6	6	283619	283624	0 %	0 %	0 %	100 %	222106359
4785	NC_011988	CG	3	6	283637	283642	0 %	0 %	50 %	50 %	222106359
4786	NC_011988	GCA	2	6	283653	283658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106359
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4799	NC_011988	ACC	2	6	284279	284284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106359
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4802	NC_011988	CAA	2	6	284398	284403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106359
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4820	NC_011988	CTG	3	9	285120	285128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106360
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4833	NC_011988	TGA	2	6	285806	285811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106361
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4850	NC_011988	CGTC	2	8	287132	287139	0 %	25 %	25 %	50 %	222106362
4851	NC_011988	TCA	2	6	287201	287206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106362
4852	NC_011988	CCCGGC	2	12	287220	287231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106362
4853	NC_011988	CGG	2	6	287305	287310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106362
4854	NC_011988	CAG	2	6	287362	287367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106362
4855	NC_011988	CAA	2	6	287475	287480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106362
4856	NC_011988	CGG	2	6	287502	287507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106362
4857	NC_011988	GA	3	6	287523	287528	50 %	0 %	50 %	0 %	222106362
4858	NC_011988	CCGA	2	8	287545	287552	25 %	0 %	25 %	50 %	222106362
4859	NC_011988	TCAT	2	8	287558	287565	25 %	50 %	0 %	25 %	222106362
4860	NC_011988	AGCGC	2	10	287571	287580	20 %	0 %	40 %	40 %	222106362
4861	NC_011988	CTCG	2	8	287586	287593	0 %	25 %	25 %	50 %	222106362
4862	NC_011988	GC	3	6	287604	287609	0 %	0 %	50 %	50 %	222106362
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4982	NC_011988	TGC	2	6	294793	294798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106367
4983	NC_011988	CTG	2	6	294804	294809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106367
4984	NC_011988	GGC	2	6	294863	294868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106367
4985	NC_011988	CGA	2	6	294896	294901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106367
4986	NC_011988	TGC	2	6	294928	294933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106367
4987	NC_011988	CGG	2	6	294935	294940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106367
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